De fleste STR-er finnes i de ikke-kodende regionene, mens bare rundt 8 % befinner seg i de kodende regionene (3). Dessuten varierer tetthetene deres litt mellom kromosomene. Hos mennesker har kromosom 19 den høyeste tettheten av STR (4). I gjennomsnitt forekommer én STR per 2000 bp i det menneskelige genomet (5).
Hvor kan jeg finne korte tandem-repetisjoner?
DNA-separasjonerEtter PCR-amplifisering, måles den totale lengden av STR-amplikonet for å bestemme antall repetisjoner som er tilstede i hver allel som finnes i DNA-profilen. Denne lengdemålingen gjøres via en størrelsesbasert separasjon som involverer gel- eller kapillærelektroforese (CE).
Hvor finnes tandem-repetisjoner?
Tandem-repetisjoner forekommer i DNA når et mønster av ett eller flere nukleotider gjentas og repetisjonene er direkte ved siden av hverandre. Flere proteindomener danner også tandem-repetisjoner innenfor deres primære aminosyrestruktur, for eksempel beltedyr-repetisjoner.
Hvor mange korte tandem-repetisjoner er det?
I 1997 nominerte Federal Bureau of Investigation (FBI) 13 autosomale STR loci til å danne kjernen i Combined DNA Index System (CODIS), en database bestående av profiler bidratt av føderale, statlige og lokale rettsmedisinske laboratorier.
Har alle de samme korte tandem-repetisjonene?
Undersøkelse av disse ikke-kodende regionene avslører gjentatte DNA-enheter som varierer i lengde mellom individer. Forskere har funnet ut at én bestemt type repetisjon, kjent som en kort tandem-repetisjon (STR), er relativt enkelt å måle og sammenligne mellom forskjellige individer
