BigWig er et filformat for visning av tette, kontinuerlige data i et genomnettleserspor, opprettet ved konvertering fra Wiggle-format (WIG). BigWig-formatet er beskrevet på UCSC Genome Bioinformatics-nettstedet, og Broad Institute-filformatguiden gir tilleggsinformasjon.
Hva er bigWig-format?
BigWig-formatet er for visning av tette, kontinuerlige data som vil bli vist som en graf BigWig-filer opprettes i utgangspunktet fra WIG-typefiler ved å bruke UCSC-programmet wigToBigWig. Alternativt kan bigWig-filer opprettes fra bedGraph-filer ved å bruke UCSC-programmet bedGraphToBigWig.
Hvordan bruker jeg bigWig-fil?
Flytt den nyopprettede bigWig-filen (myBigWig.bw) til en netttilgjengelig http-, https eller ftp-posisjon. Lim inn nettadressen i det tilpassede sporregistreringsskjemaet eller lag et tilpasset spor ved hjelp av en enkelt sporlinje. Lim inn den egendefinerte sporlinjen i tekstboksen på siden for egendefinert sporadministrasjon.
Hva er et bigWig-spor?
bigWig-spor er spor for kontinuerlige signaler over hele genomet. De er egnet for visning av ulike «rå» eksperimentresultater som ChIP-Seq-signaler, RNA-Seq-signaler osv.
Hvordan lager jeg en bigWig-fil?
Det er flere måter å generere bigwig-filer på. Dette innebærer vanligvis å konvertere en. bam-fil til et wiggle-spor (. wig) og deretter konvertere wiggle-sporet til en binær bigwig (.
